空气过滤在卫生保健机构的重要性胜于在其他任何一个地方，在这里，空气中传染性污染物的的水平随着被感染人口密度的增加而相应的升高。同时，我们关心的不仅仅是医院里，许多感染性污染物的传染也出现在门诊部门。另外，病人的聚集使污染物发生传递的机会升高，其他的卫生保健机构也需要控制空气品质，例如疗养院，牙科或者门诊临床等等。
    许多权威部门制定了卫生保健场所空气过滤等级的准则，经过以下部门的验证认可：包含美国卫生部，美国采暖，制冷与空调工程师学会以及疾病控制预防中心。
    当空气过滤器组成空气品质全面控制项目的一部分时，其对于卫生保健机构空气中的疫病的保护有巨大的作用。空气过滤器，过滤器箱体或者框架保证了空调空间换气，温度和湿度控制，新风进入和气流适当的控制，保护病人避免不适当的接触。例如烧伤病室的病人，对于他们的保护就需要特殊考虑。
    卫生保健场所的员工保护也是极为重要的。临床人员和后勤人员都受与病人接触的影响。合适的空气过滤的应用可以从数量级上降低风险。